基因间隔区 编辑

位于基因与基因之间的DNA序列
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基因间隔区/基因间区(intergenic region),它不为氨基酸编码,长短不一,短的仅几个核苷酸。在真核生物中它可能包含一些调控序列

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基本信息

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中文名:基因间隔区

外文名:intergenicregion

缩写:IGR

定义

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基因间隔区(IGR)是位于基因与基因之间的一段DNA序列。IGR的少数序列会影响基因的表现,偶尔有一些可以控制其附近的基因,但大部分都没有已知的能。它有时亦被称为垃圾DNA。最近从IGR的DNA片段转录成的RNA被称为“暗物质”或“暗物质转录物”。

特性

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IGR不同于在基因编码区内含子,它是高频存在于在生物,尤其真核生物的非编码区的短DNA序列,在人类基因组中占大数。

根据DNA元件百科全书计划(ENCODE)对人类基因组的研究,通过发现新异构体扩大基因区域和鉴定新的基因间隔区转录本,基因间区域的数显著增加(从32,481到60,250)。 科学家已经根据基因间区域人工合成了蛋白质

功能

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因为IGR没有功能所以它曾被称为垃圾DNA。然而,近些年来发现这些区域确实含有功能上重要的元件,例如启动子增强子。特别地,基因间隔区含有的增强子DNA序列,其可以对几千个碱基对以外的的距离上的离散基因进行激活表达。改变与增强子结合的蛋白质会导致基因表达重调并影响细胞表型。基因间区域也可能包含尚未鉴定的基因,如非编码RNA。虽然对它们暂时知之甚少,但它们被认为具有调节功能。特别是在人类基因组中,它占比将近95%,而在细菌酵母中,它的比例很低,只有15%-30%。近年来,随着ENCODE项目的进展,人类的基因间区域正在被更详细的研究。

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