开放阅读框编辑

结构基因的正常核苷酸序列

特别提示：本站内容仅供初步参考，难免存在疏漏、错误等情况，请您核实后再引用。对于用药、诊疗等医学专业内容，建议您直接咨询医生，以免错误用药或延误病情，本站内容不构成对您的任何建议、指导。

在分子生物学中，开放阅读框（Open Reading Frame，ORF）从起始密码子开始，结束于终止密码子连续的碱基序列，是DNA序列中具有编码蛋白质潜能的序列。由于密码子（codon）读写起始位点的不同，mRNA序列可能按六种ORF阅读和翻译（每条链三种，对应三种不同的起始位点）。ORF识别则是确定哪种开放阅读框对应真正的多肽编码序列的过程。在真核生物中，ORF可能跨过外显子，在mRNA中进行拼接。

在mRNA序列中，每三个连续碱基（即三联“密码子”）编码相应的氨基酸。其中有一个起始密码子AUG和三个终止密码子UAA、UAG、UGA。核糖体从起始密码子开始翻译，沿着mRNA序列合成多肽链并不断延伸，遇到终止密码子时，多肽链的延伸反应终止。由于读写位置不同，ORF在下图链上具有六种可能性。

一条链中的3种ORF

软件介绍

编辑

现在有很多找ORF的软件，包括在线的，如：ORF Finder的功能ORF Finder被用来预测已存在的编码区的小基因序列。它较早应于序列设计，应用优于长片断、高质量的匹配。ORF Finder把提交序列分成六个亚区，并对这六个阅读框分别进行默认，赋予每个亚区一个确定其编码内容的度量，如果可能将对每一亚区进行进一步分析。每个亚区按照已有的分类结果，被随机提交给查找它们是否编码蛋白质的特定测试收集器。最后只有那些具有编码潜能的重要区域才被报道。