-
缺氧诱导因子 编辑
缺氧诱导因子-1 ，即低氧诱导因子-1(hypoxia inducible faCTor-1,HIF-1)是1992年Semenza和WAng首先发现的，随后确立了HIF-1的结构，并证明了其cDNA的编码顺序。HIF-1普遍存在于人和哺乳动物细胞内，常氧下(21%O2)也有表达，但合成的HIF-1蛋白很快即被细胞内氧依赖性泛素蛋白酶降解途径所降解，只有在缺氧条件下HIF-1才可稳定表达。
中文名：缺氧诱导因子
简称：HIF
外文名：hypoxia inducible factor
发现人：Semenza和Wang
HIF-1是具有转录活性的核蛋白,具有相当广泛的靶基因谱,其中包括与缺氧适应、炎症发展及肿瘤生长等相关的近100种靶基因。当其与靶基因结合后,通过转录和转录后调控使机体产生一系列反应,有些反应尽管带有适应代偿性质,但也常给机体带来病理性损害,如低氧性肺动脉高压( hypoxic pulmonary hypERTension,HPH)、肿瘤加速生长等。
HIF-1是一种异源二聚体,主要由120kD的HIF-1α和91~94kD的HIF-1β两个亚单位组成。HIF-1β亚基又称芳香烃受体核转运子(aryl hydrocARBon re-eptor nuclear translocator,ARNT),基因定位于人的1号染色体q21区,在细胞内稳定表达,起结构性作用;HIF-1α基因定位于人的14号染色体q21~24区,受缺氧信号的调控,是HIF-1的活性亚基。每个亚单位的氨基端均含有碱性的螺旋-环-螺旋(basic-he-lix-loop-helix,bHLH)构型和Per/Amt/Sim(PAS)结构,是其形成异源二聚体并与DNA结合所必需的结构。作为活性亚基的HIF-1α,由826个氨基酸构成,其两个末端是感受缺氧信号的活性调控区域,C末端有一个富含脯氨酸-丝氨酸-苏氨酸(Pro/Ser/Thr)的氧依赖降解结构域(oxygen-dependent degraDAtiondomain,ODDD)和反式激活结构域(transactivationdomain,TAD),即TAD-C;N末端含有TAD-N;这些结构域都是缺氧诱导蛋白稳定、核定位和转录激活的调节域,其中TAD-C发挥精细调整作用,TAD-N为激活转录所必需,可见HIF-1α亚基受缺氧调控并调节HIF-1的活性。关于HIF-1β,除了结构性组成作用外,其还可能与HIF-1在核内的稳定性及二聚化后的构象转变有关。有研究证明在ARNT缺陷的细胞不能诱导HIF-1的活性,HIF-1α亚基必须与HIF-1β亚基聚合形成异二聚体,才能发挥转录因子的作用。
HIF一1β亚基在细胞浆中稳定表达，而HIF一1α亚基在翻译后即被泛素一蛋白酶水解复合体降解。因此，在正常氧饱和度下的细胞中基本检测不到HIF一1α亚基的表达，而在缺氧状态下， HIF一1α亚基的降解被抑制，1α和β亚基形成有活性的HIF一1，转移到细胞核内调节多种基因的转录。
HIF一1调节的靶基因
促红细胞生成素(EPO)编码基因：血管内皮生长因子(VEGF)编码基因 、胰岛素样生长因子Ⅱ编码基因、内皮素一1(ET一1)“ 、血小板源性生长因子(PDGF）葡萄糖载体蛋白1、3(glucose transporter一1、3， GLUT一1、3)和糖酵解酶， 包括醛缩酶A(aldolase A，ALDA)、烯醇化酶1(eNOlase 1，ENO1)、乳酸脱氢酶A(1actate dehedrogenase A ，LDHA)、磷酸果糖激酶L(phosphofructokinase L，PFKL)、磷酸甘油酸激酶1(phosphoglycerate kinase1，PGK1)、己糖基酶，2、3一磷酸甘油醛脱氢(glyceraldehydes一3一ph0sphate dehydrogenase，GAPDH)编码基因。
HIF的生物学效应
这些基因表达后参与，如红细胞生成，血管形成，核苷、氨基酸、糖的能量代谢，细胞存活、凋亡和活动以及药物抵抗等生物学效应，以维持组织、细胞在缺氧条件下内环境稳定，以适应缺氧。同时HIF一1及其诱导表达的基因还在生理性缺氧如干细胞微环境、胎盘发育、胚胎发育过程中组织细胞分化，以及多种病理情况如肿瘤的发展、转移中发挥着重要作用。
缺氧大部分需要氧气呼吸的物种，都拥有保守序列HIF-1。其转录都有严格的调控机制。HIF-1是由一个α亚基和一个β亚基组成的异源蛋白二聚体，而β亚基是一种芳基烃受体核转位（ARNT)。 HIF-1属于碱性螺旋-环-螺旋（bHLH）家族中的PER-ARNT-SIM（PAS）亚科。 α亚基和β亚基的结构类似，且都包含下列结构域：
- N-末端- 一个bHLH结构域，能和DNA结合。
- 中间区域 -Per-ARNT-Sim(PAS)结构域，有利于形成异源蛋白二聚体。
- C-末端- 一个能与结合的蛋白质，促使转录共调节。
| 缺氧诱导因子-1HIF-1a-pVHL-ElonginB-ElonginC 复合体 的结构之一。鉴定标志HIF-1Pfam（蛋白家族查询站）PF11413 |
| 现有可用的蛋白结构： | |
|---|---|
| Pfam | structures |
| PDB（蛋白质数据库） | RCSB PDB;PDBe |
| PDBsum（蛋白质三维结构站） | structure summary |
现有可用的蛋白结构：
Pfamstructures
PDB（蛋白质数据库）RCSB PDB;PDBe
PDBsum（蛋白质三维结构站）structure summary
HIF-1α的C末端激活域
缺氧诱导因子-1,α亚基 的结构之一 .
鉴定
标志HIF-1a_CTAD
Pfam（蛋白家族查询站）PF08778
InterPro（蛋白数据整合站）IPR014887
SCOP（蛋白结构分类数据站）1l3e
| 现有可用的蛋白结构： | |
|---|---|
| Pfam | structures |
| PDB（蛋白质数据库） | RCSB PDB;PDBe |
| PDBsum（蛋白质三维结构站） | structure summary |
现有可用的蛋白结构：
Pfamstructures
PDB（蛋白质数据库）RCSB PDB;PDBe
PDBsum（蛋白质三维结构站）structure summary
下列为人类的 HIF 家族:
| 成员 | 基因 | 蛋白 |
|---|---|---|
| HIF-1α | HIF1A | 缺氧诱导因子-1,α亚基 |
| HIF-1β | HIF-1β | 芳香烃受体核转 |
| HIF-2α | EPAS1 | 内皮PAS域蛋白-1 |
| HIF-2β | ARNT2 | 芳基烃受体核转-2 |
| HIF-3α | HIF3A | 缺氧诱导因子-3,α亚基 |
| HIF-3β | ARNTL | 芳基烃受体核转-3 |
在细胞中，HIF信号级联反应会受到缺氧状态的影响。在缺氧状态下，通常会让细胞持续的细胞分化。然而，缺氧状态促进了血管新生，对于胚胎中的血管系统与癌症肿瘤来说非常重要。 伤口处的缺氧状态，也促进了角质细胞的移动与上皮组织的修护。
在普遍情况下，HIF是发育的重要关键。在哺乳动物中，若缺少了HIF-1的基因，将导致胎儿死亡。HIF-1已经被证实，对于软骨细胞的存亡有重大的影响，他能使软骨细胞适应在骨骼间生长板的缺氧环境。缺氧诱导因子在人类的代谢调节中，属于一个核心角色。
HIF中α亚基上的脯氨酸残基会透过HIF脯氨酰羟化酶羟基化，而使其能被 VHL E3泛素连接酶辨识并泛素化，之后透过蛋白酶体使其被快速降解。这只会发生在含氧量正常的条件。但在缺氧条件下，HIF脯氨酰羟化酶会被抑制，因为它利用氧作为辅助基质。
在琥珀酸去氢酶复合物中，电子转移的抑制是因为SDHB或SDHD基因的突变，其会导致琥珀的积聚，进而抑制HIF脯氨酰羟化酶的活性，稳定HIF-1,α，这被称为伪组织缺氧。
HIF-1，当持续在缺氧条件下，正向调节多种基因以能在低含氧量的情况下生存。 HIF-1能调节的酵素包括糖解作用酶，使其能以不耗氧的方式合成三磷酸腺苷；还有血管内皮生长因子（VEGF），能促进血管新生。HIF-1的触发，是借由HIF-反应元件（HREs）结合到了启动子上的NCGTG序列。
已有实验证明，肌A激酶锚定蛋白（mAKAP）组成的E3泛素连接酶能作用于HIF-1，影响其稳定性与定位，使其移动至细胞核中。 当 mAKAP 耗尽或因其他因素干扰 mAKAP 定位在细胞核(心肌细胞)周围区域时，会影响了HIF的稳定性，与其他和缺氧相关基因的转录活性。因此，将对氧气敏感的信号物件“区域化”，可能影响缺氧时反应的进行。
在过去，与缺氧环境下HIF的调控机制资讯相较而言，含氧量正常时透过NF-κB介入的HIF调控机制和功能讯，尚处于不明确的状况。同样的，HIF-1α亚基的稳定性，在非缺氧环境下，其运作机制也是未知的。但近期指出，NF-κB（NF-κB）是HIF-1α在正常含氧量下的直接调节因子。以小干扰RNA作用在NF-κB上发现到，其会影响HIF-1α mRNA 的表现程度，因此证实了NF-κB能HIF-1α的表现。最后，当进行肿瘤坏死因子-α(TNAα)治疗时，NF-κB被大量诱导表现，HIF-1α表现程度也受到影响。HIF-1和HIF-2具有不同的生理作用。 HIF-2用于调节成人体内的红血球生成素。
最近，多种作用为选择性的HIF脯氨酰羟化酶的抑制剂已经被开发了。其中最引人注目的包括FibroGen公司的化合物FG-2216和FG-4592，是两个以口服方式治疗的药物。借由抑制HIF脯氨酰羟化酶，使HIF-2α在肾的稳定性增加，这导致红血球生成素的生产的。 这两种药物对II期临床试验已经成功了，但这些都在2007年5月暂停了，因为有试验参发生暴发性肝炎死亡。不过，目前还不清楚肝炎死亡是否是由FG-2216所引起的。在2008年年初，因美国FDA的审查和批准，解除临床试验的暂停。
炎症和癌症
在其它情况中，并接续上面的治疗主题。最近的研究表明，在常氧状态下诱导HIF表现，可能造成含有慢性炎性成分的疾病。 且已经表明，慢性炎症是自我延续的，并且是因为微环境的异常，而导致转录因子被异常活化的结果。发生在细胞中，生长因子、趋化因子、细胞因子和活性氧平衡的改变，反过提供生长的需要，造成癌症发生与转移。 最近发表的研究结果包含了许多病症，其中有NF-κB和HIF-1的失调，也有类风湿关节炎和癌症。 因此，了解NF-κB和HIF两著之间的关系，将大大提高药物开发的发展。
HIF的活性涉及到了血管新生，也造成肿瘤的生长，所以HIF的抑制剂，如异硫氰酸苯乙酯(Phenethyl isothiocyanate)和吖啶黄正在接受抗癌作用的测试。
