体外转录 编辑

DNA转录技术
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转录通常发生生物体内,如果我们将含有RNA转录、NTP条件,在体外细胞系统中,用DNA作为模板,模仿体内转录过程生成RNA,这样的技术则能够控制转录的基因、转录的过程和转录后RNA的用途,该技术被称为体外转录。

基本信息

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中文名:体外转录

前提:基因组全长克隆过程

性质:T7启动子作为体外转录启动子

第一步:提取cDNA质粒

转录条件

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转录模板必须满足:

1. 在基因组全长克隆过程中,在正向引物5‘末端添加T7启动子序列;

2. 以T7启动子作为体外转录启动子,在启动子后面靶位序列连续带有3个G,转录效率最 高;

3. 在正向引物5/端添加一个帽子G,有利于提高体外转录RNA分子的侵染活性

操作步骤

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1. 提取cDNA质粒;

2. 线性化质粒:(利用单一的酶切位点线性化有利于转录)

3. 纯化质粒:(尽避免RNase污染) ① 加等体积的Tris-苯酚:氯仿(1:1)到100μL限制内切酶消化体系,涡旋振荡20s, 13000g离5min; ②上清转移,加入2倍体积无乙醇和1/10体积的3M的醋酸(pH5.2),-20℃放置不少于2h或过夜放置; ③DNA质粒13000g离心5min ,并且用20μL H2O重悬,放于-20℃。

4. 体外转录:(根据以下组成配制反应液,轻轻混匀)

10*basal reaCTion buffer

2μL 5*accelerator solution

4μL 25mM rNTPs mixture

4.5μL RNase Inhibitor

0.5μL Template DNA

100ng-1μg Thermo T7 RNA polymerase

1μL Nuclease-free water

up to 20μL Total volume 20μL

5. 在37℃-42℃下放置2小时。

6. 转录产物可通过1%非变性琼脂来检测:取产物1μL,160V电压,结果应为两条带, 上为DNA模板,下为RNA 产物。

注意: 1. 模板DNA(环状或线型):必须具有T7启动子位点。同时,模板应为RNase-free级。在 质粒提取过程中如使用了RNase,必须通过苯酚·氯仿处理等方法除去RNase。

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