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体外转录 编辑
转录通常发生在生物体内,如果我们将含有RNA转录酶、NTP等条件,在体外无细胞系统中,用DNA作为模板,模仿体内转录过程生成RNA,这样的技术则能够控制转录的基因、转录的过程和转录后RNA的用途,该技术被称为体外转录。
1. 提取cDNA质粒;
2. 线性化质粒:(利用单一的酶切位点线性化有利于转录)
3. 纯化质粒:(尽量避免RNase污染) ① 加等体积的Tris-苯酚:氯仿(1:1)到100μL限制内切酶消化体系,涡旋振荡20s, 13000g离心5min; ②上清转移,加入2倍体积无水乙醇和1/10体积的3M的醋酸钠(pH5.2),-20℃放置不少于2h或过夜放置; ③DNA质粒13000g离心5min ,并且用20μL H2O重悬,放于-20℃。
4. 体外转录:(根据以下组成配制反应液,轻轻混匀)
10*basal reaCTion buffer
2μL 5*accelerator solution
4μL 25mM rNTPs mixture
4.5μL RNase Inhibitor
0.5μL Template DNA
100ng-1μg Thermo T7 RNA polymerase
1μL Nuclease-free water
up to 20μL Total volume 20μL
5. 在37℃-42℃下放置2小时。
6. 转录产物可通过1%非变性琼脂糖来检测:取产物1μL,160V电压,结果应为两条带, 上为DNA模板,下为RNA 产物。
注意: 1. 模板DNA(环状或线型):必须具有T7启动子位点。同时,模板应为RNase-free级。在 质粒提取过程中如使用了RNase,必须通过苯酚·氯仿处理等方法除去RNase。